| 01 | Канцелярія |
| 02 | Відділ документування та обліку документів |
| 03 | Архів |
| 04 | Секретаріат вченої ради університету |
| 05 | Організаційний відділ |
| 06 | Юридичний відділ |
| 07 | Бухгалтерська служба |
| 08 | Планово-фінансовий відділ |
| 09 | Відділ кадрів |
| 010 | Відділ внутрішнього аудиту |
| 011 | Штаб цивільного захисту базового закладу університету |
| 012 | Військово-мобілізаційний підрозділ |
| 013 | Режимно-секретний відділ |
| 014 | Відділ охорони праці |
| 015 | Відділ земельних ресурсів |
| 016 | Відділ постачання та моніторингу цін |
| 017 | Відділ державних закупівель |
| 018 | Приймальна комісія |
| 019 | Редакційно-видавничий відділ |
| 020 | Навчально-науковий центр міжнародної діяльності |
| 021 | Навчальний відділ |
| 022 | Відділ з працевлаштування випускників та видачі документів про вищу освіту |
| 023 | Відділ регіонального розвитку, дистанційної освіти та заочного навчання |
| 024 | Відділ якості освіти, маркетингу та профоріентаційної роботи |
| 025 | Навчально-методичний відділ |
| 026 | Наукова бібліотека |
| 027 | Музей історії НУБіП України |
| 028 | Відділ виховної роботи та студентських справ |
| 029 | Студентське містечко |
| 030 | Відділ аспірантури |
| 031 | Науково-організаційний відділ (НДЧ) |
| 032 | Планово-фінансовий відділ НДЧ |
| 033 | Відділ патентно-ліцензійної, винахідницької та раціоналізаторської роботи |
| 034 | Відділ науково-технічної інформаціі |
| 035 | Відділ докторантури та атестації наукових кадрів |
| 036 | Відділ організаційної діяльності НДГ та навчально-виробничої практики |
| 037 | Інформаційно-обчислювальний центр |
| 038 | Відділ соціальної роботи |
| 039 | Оздоровчий центр НУБіП України |
| 040 | Служба закладів харчування |
| 041 | Експлуатаційно-технічний відділ |
| 042 | Відділ головного механіка |
| 043 | Відділ головного енергетика |
| 044 | Виробничий відділ |
| 045 | Господарський відділ |
| 046 | Відділ комплексної безпеки та експлуатаційно-технічного забезпечення об’ектів охорони |
| 047 | Відділ пожежної безпеки |
| 048 | Кошторисно-договірний відділ |
| 049 | Центральний склад |
| 050 | Навчально-науково-виробничий центр «Автоінжиніринг» |
