| 01 | Канцелярія |
| 02 | Відділ документування та обліку документів |
| 03 | Архів |
| 04 | Секретаріат вченої ради університету |
| 05 | Організаційний відділ |
| 06 | Юридичний відділ |
| 07 | Бухгалтерська служба |
| 08 | Планово-фінансовий відділ |
| 09 | Відділ кадрів |
| 010 | Відділ внутрішнього аудиту |
| 011 | Підрозділ військової мобілізації та взаємодії із ЗСУ |
| 012 | Режимно-секретний відділ |
| 013 | Відділ охорони праці |
| 014 | Приймальна комісія |
| 015 | Навчальний відділ |
| 016 | Навчально-методичний відділ |
| 017 | Відділ менеджменту якості |
| 018 | Відділ розвитку персоналу |
| 019 | Відділ профорієнтації та маркетингу |
| 020 | Відділ практичного навчання та працевлаштування |
| 021 | Відділ регіонального розвитку, координації діяльності ВСП та заочного навчання |
| 022 | Інформаційно-обчислювальний центр |
| 023 | Наукова бібліотека |
| 024 | Музей історії НУБіП України |
| 025 | Відділ виховної роботи та студентських справ |
| 026 | Студентське містечко |
| 027 | Відділ соціальної роботи |
| 028 | Оздоровчий центр НУБіП України |
| 029 | Відділ аспірантури, докторантури та атестації наукових кадрів |
| 030 | Науково-організаційний відділ (НДЧ) |
| 031 | Планово-фінансовий відділ НДЧ |
| 032 | Відділ патентно-ліцензійної, винахідницької та раціоналізаторської роботи |
| 033 | Відділ науково-технічної інформації |
| 034 | Відділ організаційної діяльності НДГ та навчально-виробничої практики |
| 035 | Відділ державних закупівель |
| 036 | Служба закладів харчування |
| 037 | Відділ міжнародних зв’язків |
| 038 | Відділ по роботі з іноземними студентами |
| 039 | Відділ міжнародних проєктів |
| 040 | Редакційно-видавничий відділ |
| 041 | Експлуатаційно-технічний відділ |
| 042 | Відділ головного механіка |
| 043 | Відділ головного енергетика |
| 044 | Виробничий відділ |
| 045 | Господарський відділ |
| 046 | Відділ комплексної безпеки та експлуатаційно-технічного забезпечення об’ектів охорони |
| 047 | Відділ з надзвичайних ситуацій |
| 048 | Кошторисно-договірний відділ |
| 049 | Відділ постачання, обліку та видачі товарів |
| 050 | Навчально-науково-виробничий центр «Автоінжиніринг» |
| 051 | Відділ земельних ресурсів |
| 052 | ННІ енергетики, автоматики і енергозбереження |
| 053 | ННІ лісового і садово-паркового господарства |
| 054 | ННІ неперервної освіти і туризму |
| 055 | Агробіологічний факультет |
| 056 | Гуманітарно-педагогічний факультет |
| 057 | Економічний факультет |
| 058 | Механіко-технологічний факультет |
| 059 | Факультет аграрного менеджменту |
| 060 | Факультет ветеринарної медицини |
| 061 | Факультет захисту рослин, біотехнологій та екології |
| 062 | Факультет землевпорядкування |
| 063 | Факультет інформаційних технологій |
| 064 | Факультет конструювання та дизайну |
| 065 | Факультет тваринництва та водних біоресурсів |
| 066 | Факультет харчових технологій та управління якістю продукції АПК |
| 067 | Юридичний факультет |
| 068 | Кафедра військової підготовки |
| 069 | Українська лабораторія якості і безпеки продукції АПК |
| 070 | Український НДІ сільськогосподарської радіології |
| 071 | Науково-дослідний та проектний інститут стандартизації і технологій екобезпечної та органічної продукції (м. Одеса) |
